RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SCAI	Q8N9R8	606 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	S1PR5	Q9H228	398 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM60A	Q9NP50	221 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CHST10	O43529	356 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR10H2	O60403	315 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IGHA1	P01876	353 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NOS3	P29474	1203 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PLAUR	Q03405	335 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IL18	Q14116	193 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RSC1A1	Q92681	617 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MED18	Q9BUE0	208 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ALG8	Q9BVK2	526 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		12.13	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BHLHE40	O14503	412 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PLOD3	O60568	738 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM11	O75078	769 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TBXA2R	P21731	343 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ASB12	Q8WXK4	309 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PTP4A1	Q93096	173 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	IL21R	Q9HBE5	538 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	LYRM4	Q9HD34	91 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MEIOC	A2RUB1	952 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF10C	O14798	259 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BMP8B	P34820	402 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FOXK2	Q01167	660 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT2	Q10469	447 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ERV3-1	Q14264	604 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		Q8N402	240 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TP53INP1	Q96A56	240 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A4	Q9H015	551 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF221	Q9UK13	617 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	MED31	Q9Y3C7	131 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC182	A6NF36	153 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HRK	O00198	91 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BRINP1	O60477	761 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA4F	O95754	770 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ST6GAL1	P15907	406 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GABRG2	P18507	467 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	HTR4	Q13639	388 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ARL9	Q6T311	187 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	OR52N1	Q8NH53	320 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	ATF6B	Q99941	703 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.12	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0J9YY10	115 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152		E9PI62	339 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R3D	O95685	299 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	TNF	P01375	233 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	AMZ1	Q400G9	498 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	RPTN	Q6XPR3	784 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GID4	Q8IVV7	300 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	GHDC	Q8N2G8	530 aa		12.11	□□□□□ -0.47
BRF1-222	ENST00000635152	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		12.11	□□□□□ -0.47

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