RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 NMNAT3Q96T66 252 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 HHATLQ9HCP6 504 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PLXNA3P51805 1871 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MCIDASD6RGH6 385 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 DVL2O14641 736 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GPX5O75715 221 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CLDN12P56749 244 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SKP1P63208 163 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 DMWDQ09019 674 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FUT5Q11128 374 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CBX3Q13185 183 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MED25Q71SY5 747 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 UFD1Q92890 307 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 RASD2Q96D21 266 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 GABRG3Q99928 467 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MMP28Q9H239 520 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 FGF21Q9NSA1 209 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 CENPMQ9NSP4 180 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 LIPT1Q9Y234 373 aa6.96□□□□□ -1.29
PKP4-217ENST00000628904 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 A0A0B4J203 849 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 A0A1B0GWA3 101 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 UNC119BA6NIH7 251 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PAHP00439 452 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 KRT8P05787 483 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 CD1CP29017 333 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 GRK6P43250 576 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 ZNF33BQ06732 778 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 CARD17Q5XLA6 110 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 CBLN3Q6UW01 205 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 ENKURQ8TC29 256 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 GPR119Q8TDV5 335 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MENTQ9BUN1 341 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MND1Q9BWT6 205 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 OR2A25A4D2G3 310 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SSX4O60224 188 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 RAB36O95755 333 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PSKH1P11801 424 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 CXCR4P61073 352 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 FAM53BQ14153 422 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 DECR1Q16698 335 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 LUZP2Q86TE4 346 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 POT1Q9NUX5 634 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MCUBQ9NWR8 336 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 A0A0G2JNG1 304 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 ZNF749O43361 778 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MBTPS2O43462 519 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 WNT1P04628 370 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 MAKP20794 623 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 AQP2P41181 271 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 TUBA3CQ13748 450 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 KIR2DS5Q14953 304 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-217ENST00000628904 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms