RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CADP27708 2225 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 GJE1A6NN92 205 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CLOCKO15516 846 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CRLF1O75462 422 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 PRKD3O94806 890 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT14O95848 222 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CD3EP07766 207 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 YES1P07947 543 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V1C1P21283 382 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 P2RX1P51575 399 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ETFDHQ16134 617 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CDC73Q6P1J9 531 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF527Q8NB42 609 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW5Q969U6 566 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 STAB1Q9NY15 2570 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 MXRA5Q9NR99 2828 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRF-216ENST00000617451 RNF223E7ERA6 249 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ADAP00813 363 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 FGF4P08620 206 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KRT4P19013 534 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 HPCAL1P37235 193 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 VEZF1Q14119 521 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PCLAFQ15004 111 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 P2RY6Q15077 328 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GPR119Q8TDV5 335 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 MID2Q9UJV3 735 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ABCA1O95477 2261 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF814B7Z6K7 855 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA7E9PJI5 369 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 H3BNH8 94 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM13O60858 407 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA8P0DM63 369 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 LAMP1P11279 417 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PRKCAP17252 672 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ITGADQ13349 1161 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 HOMEZQ8IX15 550 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DDIASQ8IXT1 998 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SLC43A2Q8N370 569 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 BANPQ8N9N5 519 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA3Q8NHX4 192 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZFP90Q8TF47 636 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NEUROG1Q92886 237 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF524Q96C55 264 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PPCSQ9HAB8 311 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM23A6NLE4 172 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM114B3SHH9 223 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM233B4DJY2 109 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ENPP1P22413 925 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 IDUAP35475 653 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 RPL3P39023 403 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ATP12AP54707 1039 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DCST2Q5T1A1 773 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 REG4Q9BYZ8 158 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 BCO1Q9HAY6 547 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF6Q9Y4K3 522 aa22.12■■□□□ 1.13
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