RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591833.5

SEPT9-240, Transcript of septin 9, human

TSL 4

Gene SEPT9, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-240	ENST00000591833	TMEM233	B4DJY2	109 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833		H3BNH8	94 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CXCL13	O43927	109 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PEX11A	O75192	247 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SERPINE1	P05121	402 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	INHBB	P09529	407 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	LINGO3	P0C6S8	592 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PRPS1L1	P21108	318 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CARD18	P57730	90 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	BEX5	Q5H9J7	111 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	HBM	Q6B0K9	141 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GATS	Q8NAP1	163 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	KLHL15	Q96M94	604 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GP6	Q9HCN6	339 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833		A0A0J9YW62	118 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GJE1	A6NN92	205 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ARID1A	O14497	2285 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	TNFSF11	O14788	317 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	TMCC2	O75069	709 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	TGDS	O95455	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37	3e-7	■■□□□ 13.3
SEPT9-240	ENST00000591833	LAMP1	P11279	417 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	P2RX1	P51575	399 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	NR1H2	P55055	460 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CD226	Q15762	336 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CHI3L2	Q15782	390 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	KLHL26	Q53HC5	615 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	POC1B	Q8TC44	478 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SFXN5	Q8TD22	340 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	OSTF1	Q92882	214 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CDS1	Q92903	461 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CCL19	Q99731	98 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	MECR	Q9BV79	373 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	THAP1	Q9NVV9	213 aa		12.75	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	WDR91	A4D1P6	747 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	DUXA	A6NLW8	204 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	KLF4	O43474	513 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	NID1	P14543	1247 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	BGN	P21810	368 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ATP12A	P54707	1039 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	C21orf58	P58505	322 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF117	Q03924	483 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	STX3	Q13277	289 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	TP53BP2	Q13625	1128 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	PTGR1	Q14914	329 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833		Q5PR19	223 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	DCST2	Q5T1A1	773 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	IL23R	Q5VWK5	629 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	NPAS1	Q99742	590 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	BDH2	Q9BUT1	245 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SEPT9-240	ENST00000591833	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		12.74	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms