RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590220.1

PIK3C3-213, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, human

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LCE6A	A0A183	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	C1orf226	A1L170	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PLOD3	O60568	738 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	STK16	O75716	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SEMA3D	O95025	777 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	WNT11	O96014	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CRYAA	P02489	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	GSN	P06396	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NGFR	P08138	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CSF1	P09603	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MTHFD2	P13995	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PCSK2	P16519	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NPR2	P20594	1047 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NTF4	P34130	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MAGEA3	P43357	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ATP4B	P51164	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PGGT1B	P53609	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PRPS1	P60891	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	POU4F1	Q01851	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	STX5	Q13190	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PDCD1	Q15116	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIK3C3-213	ENST00000590220	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220		H0YIV9	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	NDUFB5	O43674	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	ERLIN1	O75477	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	TTC4	O95801	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	HPX	P02790	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	ADRA2A	P08913	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	PCNA	P12004	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	GPC1	P35052	558 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	PCGF2	P35227	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	SFTPD	P35247	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIK3C3-213	ENST00000590220	THBS4	P35443	961 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms