RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX14O95416 240 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGB2P05107 769 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SCG5P05408 212 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TNNI3P19429 210 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K8P41279 467 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSWIM7Q19AV6 140 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS21Q2M5E4 152 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF404Q494X3 552 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC27A4Q6P1M0 643 aa23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGFN1Q86VF2 1251 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4N4Q8N0Y3 316 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF619Q8N2I2 560 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD4AQ8N468 514 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEANCQ8N8B7 351 aa23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 SDF2Q99470 211 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC7Q9H6L4 198 aa23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.53■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 CD40LGP29965 261 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MC2RQ01718 297 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF12Q5T6F0 453 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CA13Q8N1Q1 262 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM163Q8TC26 289 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 IL4I1Q96RQ9 567 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TSSK6Q9BXA6 273 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CORINQ9Y5Q5 1042 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-204ENST00000587718 PFDN1O60925 122 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 OMPP47874 163 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.52■■□□□ 1.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLF4O43474 513 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 UBXN7O94888 489 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35E2P0CK97 266 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED1Q13445 227 aa23.51■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 NANOGP1Q8N7R0 232 aa23.51■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 COL6A6A6NMZ7 2263 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 B8ZZF3 427 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R129 80 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 RAB36O95755 333 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 SOX18P35713 384 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT14P1Q58G82 188 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9A6Q92581 669 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35B4Q969S0 331 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 COL26A1Q96A83 441 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC41A3Q96GZ6 507 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 DSN1Q9H410 356 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 IL20Q9NYY1 176 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SAGE2PA6NJ88 616 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-204ENST00000587718 FCMRO60667 390 aa23.49■■□□□ 1.35
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