RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	UBOX5	O94941	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MFN2	O95140	757 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ACTL6A	O96019	429 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF17	P17021	662 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HK1	P19367	917 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PGC	P20142	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CHM	P24386	653 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ADH6	P28332	368 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PTGS2	P35354	604 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CPOX	P36551	454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC6A8	P48029	635 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GSK3B	P49841	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GFRA1	P56159	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	DLX5	P56178	289 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MXRA7	P84157	204 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A3	Q00325	362 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PLAUR	Q03405	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CBFB	Q13951	182 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MED17	Q9NVC6	651 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BCKDK	O14874	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	C8B	P07358	591 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HSD17B1	P14061	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PLA2G2A	P14555	144 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HTR1E	P28566	365 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	AQP1	P29972	269 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	KDELR2	P33947	212 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HSF1	Q00613	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	EXO5	Q9H790	373 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ADA2	Q9NZK5	511 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SYT5	O00445	386 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC19A2	O60779	497 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CYP7B1	O75881	506 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	NUDT14	O95848	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	IFNA14	P01570	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	STS	P08842	583 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	UQCRB	P14927	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ABO	P16442	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PRKCA	P17252	672 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BMP7	P18075	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	KCNJ5	P48544	419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CCR4	P51679	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CBX1	P83916	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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