RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS4O75173 837 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 VNN2O95498 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RHOP08100 348 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ITGB7P26010 798 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 NKX3-2P78367 333 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PRRT1Q99946 306 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 BIN3Q9NQY0 253 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 FAM183AA6NL82 134 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 HSPA12AO43301 675 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CD53P19397 219 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PDHA2P29803 388 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 DLSTP36957 453 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 BTN1A1Q13410 526 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GAB1Q13480 694 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TCTE1Q5JU00 501 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SAXO2Q658L1 398 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 APOOLQ6UXV4 268 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SVBPQ8N300 66 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ARL14Q8N4G2 192 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RAD9AQ99638 391 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SRRQ9GZT4 340 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 BTAF1O14981 1849 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ASPDHA6ND91 283 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MEN1O00255 615 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 NCR1O76036 304 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TSPAN12O95859 305 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SCGB1D2O95969 90 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PNMTP11086 282 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TIMP2P16035 220 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PBX2P40425 430 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OPRD1P41143 372 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MC2RQ01718 297 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 DHCR24Q15392 516 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OPALINQ96PE5 141 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RLIMQ9NVW2 624 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ASB1Q9Y576 335 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR1A2Q9Y585 309 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GFYI3L273 518 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SNAPINO95295 136 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR2T7P0C7T2 308 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PTPN6P29350 595 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SEC13P55735 322 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TAS2R19P59542 299 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CTXN1P60606 82 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR2T27Q8NH04 317 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ABHD4Q8TB40 342 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MYADMQ96S97 322 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 A6NL46 340 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 H3BSH0 61 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 H7C417 338 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MAOAP21397 527 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PRKAR1BP31321 381 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PTOV1Q86YD1 416 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 IL17RDQ8NFM7 739 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PMEPA1Q969W9 287 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms