RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 ENO4A6NNW6 628 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 A8MXE2 369 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 H3BNH8 94 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 MSTNO14793 375 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 OIP5O43482 229 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EFNA2O43921 213 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 STX11O75558 287 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTAG2O75638 210 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOSR1O95249 250 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 AGR2O95994 175 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CGAP01215 116 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PGRP06401 933 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 NPIPA8P0DM63 369 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 IDO1P14902 403 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 HPGDP15428 266 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ELK4P28324 431 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 S100A3P33764 101 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SOAT1P35610 550 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAGEA8P43361 318 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIR2DL3P43628 341 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 P2RX1P51575 399 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FUT5Q11128 374 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GSTA3Q16772 222 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 TTMPQ5BVD1 217 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CBLN3Q6UW01 205 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANKRD46Q86W74 232 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIF18BQ86Y91 864 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GATSQ8NAP1 163 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPR119Q8TDV5 335 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM222BQ8WU58 562 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FIG4Q92562 907 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 STARD4Q96DR4 205 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 C7orf26Q96N11 449 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF559Q9BR84 538 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR51I1Q9H343 314 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EXD2Q9NVH0 621 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 STOML1Q9UBI4 398 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 VDAC3Q9Y277 283 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 MED13LQ71F56 2210 aa6.66□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERINC4A6NH21 518 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 H3BML4 177 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 HMGN4O00479 90 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIAA0513O60268 411 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCMRO60667 390 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC22A3O75751 556 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 UGT2B17O75795 530 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 AQP8O94778 261 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 TGDSO95455 350 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL6P05231 212 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR12D1P0DN82 309 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 VSIG8P0DPA2 414 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KITP10721 976 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 CD8BP10966 210 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCGR2AP12318 317 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKCAP17252 672 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL11P20809 199 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 UQCRC1P31930 480 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 KHKP50053 298 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 MVDP53602 400 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLAURQ03405 335 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 FOXF1Q12946 379 aa6.65□□□□□ -1.34
UBE2CP4-201ENST00000561405 SKP2Q13309 424 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms