RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555506.1

KTN1-222, Transcript of kinectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene KTN1, Length 1,464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KTN1-222	ENST00000555506	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SCRG1	O75711	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CAPN1	P07384	714 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	PNMT	P11086	282 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	PGAM2	P15259	253 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CALB2	P22676	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CD80	P33681	288 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	FNTA	P49354	379 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SERTAD2	Q14140	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	LPAL2	Q16609	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	WSCD1	Q658N2	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	BAD	Q92934	168 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	ZBTB18	Q99592	522 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	DPH7	Q9BTV6	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	DPM3	Q9P2X0	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TAPBP	O15533	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	GPAA1	O43292	621 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	LAT	O43561	262 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SNX4	O95219	450 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SLC35E2	P0CK97	266 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CYP2B6	P20813	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	IL2RG	P31785	369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	GRIA1	P42261	906 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	P2RY1	P47900	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TNFRSF17	Q02223	184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	FGL1	Q08830	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	ZMYND11	Q15326	602 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	FAM222B	Q8WU58	562 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	NPAS2	Q99743	824 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KTN1-222	ENST00000555506	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506		B4DXG7	233 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	FCN1	O00602	326 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	CRLF1	O75462	422 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	UGT2B17	O75795	530 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	CABYR	O75952	493 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	ALOX5	P09917	674 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	PCMT1	P22061	227 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	MMP11	P24347	488 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	EFNA3	P52797	238 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	SLC25A1	P53007	311 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	SLC8A3	P57103	927 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KTN1-222	ENST00000555506	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88

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