RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR5W2	Q8NH69	310 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GJE1	A6NN92	205 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ZNF195	O14628	629 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ZNF264	O43296	627 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GMFG	O60234	142 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	UGT2B17	O75795	530 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PGR	P06401	933 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	IDO1	P14902	403 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CD1E	P15812	388 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PRKCA	P17252	672 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	EPHA3	P29320	983 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	IL12A	P29459	219 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SOAT1	P35610	550 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SLC6A8	P48029	635 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	UFM1	P61960	85 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SKP2	Q13309	424 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	LILRA2	Q8N149	483 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PMM1	Q92871	262 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OSTF1	Q92882	214 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	KLHL15	Q96M94	604 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	FOXC2	Q99958	501 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CCDC154	A6NI56	674 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CXCL13	O43927	109 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	KIAA0513	O60268	411 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SYNGR4	O95473	234 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	HRG	P04196	525 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	IL6	P05231	212 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	NPIPA8	P0DM63	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	UBL4A	P11441	157 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	UGT2B10	P36537	528 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	IST1	P53990	364 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	FOXF1	Q12946	379 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ANKRD46	Q86W74	232 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	FBXO27	Q8NI29	283 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.28	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms