RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CXCL14O95715 111 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 HLA-DQA2P01906 255 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 XKP51811 444 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PER3P56645 1201 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ABHD13Q7L211 337 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 GHITMQ9H3K2 345 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 EPHX3Q9H6B9 360 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CRLF2Q9HC73 371 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 SH3BP2P78314 561 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 TCTN1Q2MV58 587 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ACTBL2Q562R1 376 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM200AQ86VY9 491 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OR8D1Q8WZ84 308 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 MARC2Q969Z3 335 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SLC38A3Q99624 504 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 CD244Q9BZW8 370 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ADAM19Q9H013 955 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 LUZP4Q9P127 313 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 DAPL1A0PJW8 107 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 TOX4O94842 621 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TPOP07202 933 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 CPN1P15169 458 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CPT2P23786 658 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FPR3P25089 353 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CHATP28329 748 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PPT1P50897 306 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ST8SIA6P61647 398 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 IHHQ14623 411 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 ARL14Q8N4G2 192 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRD-214ENST00000540109 FGF7P21781 194 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DLSTP36957 453 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 KHKP50053 298 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 DLK1P80370 383 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 SHEQ5VZ18 495 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 TEX261Q6UWH6 196 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRD-214ENST00000540109 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.69□□□□□ -1.5
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