RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ACBD6	Q9BR61	282 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A0D9SG52	128 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	OR7A17	O14581	309 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	DLEU1	O43261	78 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDH7	O60245	1069 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ARIH2	O95376	493 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC25A27	O95847	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	THEGL	P0DJG4	465 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CLU	P10909	449 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	OSM	P13725	252 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGEB1	P43366	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	KIR3DL2	P43630	455 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	NDUFA6	P56556	154 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	WNT3A	P56704	352 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	OR10K2	Q6IF99	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	APOOL	Q6UXV4	268 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MON1A	Q86VX9	555 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	R3HDM4	Q96D70	268 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TCTN2	Q96GX1	697 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PKP4	Q99569	1192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PPT2	Q9UMR5	302 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PGRMC2	O15173	223 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	EMC8	O43402	210 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	KLK8	O60259	260 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ITGA10	O75578	1167 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC2A1	P11166	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	FOSL2	P15408	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CEACAM6	P40199	344 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PMEL	P40967	661 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CCR8	P51685	355 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CARD18	P57730	90 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ZXDB	P98169	803 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	GTF2H2	Q13888	395 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SYT14P1	Q58G82	188 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MSC	O60682	206 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	EFCAB14	O75071	495 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MOSPD3	O75425	235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	F10	P00742	488 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ARL2	P36404	184 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	ODF4	Q2M2E3	257 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	C12orf73	Q69YU5	71 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TSSK4	Q6SA08	328 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ZNF438-208	ENST00000538351	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		7.34	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms