RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ACAN	P16112	2415 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	C3orf80	F5H4A9	247 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ADAMDEC1	O15204	470 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	BIRC5	O15392	142 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF264	O43296	627 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TYROBP	O43914	113 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PRKD3	O94806	890 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TUBB	P07437	444 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PPP3CB	P16298	524 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	FPR1	P21462	350 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CRYGS	P22914	178 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SLC1A6	P48664	564 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PCYT1A	P49585	367 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ADAM8	P78325	824 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CBFB	Q13951	182 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	KLHL26	Q53HC5	615 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	XKR7	Q5GH72	579 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CROCCP2	Q86T23	111 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	C7orf72	A4D263	438 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TM9SF1	O15321	606 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	STX11	O75558	287 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	AGR2	O95994	175 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CGA	P01215	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	LINGO3	P0C6S8	592 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TFPI	P10646	304 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	UBL4A	P11441	157 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	FOSL1	P15407	271 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	LBP	P18428	481 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CD53	P19397	219 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	BGN	P21810	368 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ADH6	P28332	368 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	S100A3	P33764	101 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CASP9	P55211	416 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	HBA1	P69905	142 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF117	Q03924	483 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	FOXF1	Q12946	379 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CD226	Q15762	336 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ACKR1	Q16570	336 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SMU1	Q2TAY7	513 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SHE	Q5VZ18	495 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CBLN3	Q6UW01	205 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	OR5W2	Q8NH69	310 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF563	Q8TA94	476 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	POC1B	Q8TC44	478 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM234	Q8WY98	164 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ZIM3	Q96PE6	472 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	SDF2	Q99470	211 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	CCL19	Q99731	98 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	NPAS1	Q99742	590 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	NGB	Q9NPG2	151 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	MKLN1	Q9UL63	735 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	ARID1A	O14497	2285 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDB1-208	ENST00000537120	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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