RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529551.1

CPQ-208, Transcript of carboxypeptidase Q, human

TSL 2

Gene CPQ, Length 896 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPQ-208	ENST00000529551	COL6A5	A8TX70	2615 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551		A0A1W2PPE2	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551		A0A1W2PR64	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	LDB3	O75112	727 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ACSL3	O95573	720 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	C8G	P07360	202 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FREM3	P0C091	2139 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FCGR2A	P12318	317 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TNNI3	P19429	210 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CDA	P32320	146 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	AHR	P35869	848 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CDKN2D	P55273	166 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	RAB38	P57729	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SKP1	P63208	163 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	KCNJ2	P63252	427 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	REEP5	Q00765	189 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FOXF2	Q12947	444 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	DCST1	Q5T197	706 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	KRT80	Q6KB66	452 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	LUZP2	Q86TE4	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	KLB	Q86Z14	1044 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	LIX1	Q8N485	282 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551		Q8NFD4	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	LINGO1	Q96FE5	620 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HES6	Q96HZ4	224 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	QRFPR	Q96P65	431 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	BDH2	Q9BUT1	245 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	IFT27	Q9BW83	186 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ARID1A	O14497	2285 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	NIN	Q8N4C6	2090 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	C17orf105	B2RV13	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	IFNL4	K9M1U5	179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CLIC1	O00299	241 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CYR61	O00622	381 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CTNS	O60931	367 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CRLF1	O75462	422 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TRAPPC6A	O75865	159 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TGDS	O95455	350 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	BAG2	O95816	211 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SERPINA6	P08185	405 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HOXB5	P09067	269 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	GDF1	P27539	372 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CERS1	P27544	350 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TIMP3	P35625	211 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	SLCO1A2	P46721	670 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CAMP	P49913	170 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	PLA2G16	P53816	162 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	LIM2	P55344	173 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HSD17B7	P56937	341 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	FGFBP1	Q14512	234 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	PIGG	Q5H8A4	983 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	DUPD1	Q68J44	220 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	OPN5	Q6U736	354 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM64	Q6YI46	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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