RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 ATE1O95260 518 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 NTN1O95631 604 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 TUBBP07437 444 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 POU2F1P14859 743 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 IL12AP29459 219 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 NME5P56597 212 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 CASP8Q14790 479 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 HHATQ5VTY9 493 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 HBMQ6B0K9 141 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 OGFOD2Q6N063 350 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF550Q7Z398 422 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 OSTF1Q92882 214 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SRXN1Q9BYN0 137 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PRRG4Q9BZD6 226 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF350Q9GZX5 532 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 NDRG3Q9UGV2 375 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PROCRQ9UNN8 238 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SERINC4A6NH21 518 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 H3BNH8 94 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 GOSR1O95249 250 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 NUDT14O95848 222 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKCAP17252 672 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ME2P23368 584 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 DNASE1P24855 282 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF1P41567 113 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 UFM1P61960 85 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 FUT5Q11128 374 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 FGFBP1Q14512 234 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR68Q15743 365 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 CROCCP2Q86T23 111 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ROBO4Q8WZ75 1007 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB8BQ92930 207 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 AIG1Q9NVV5 245 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ELOVL5Q9NYP7 299 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MKLN1Q9UL63 735 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 VPS13CQ709C8 3753 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFHX3Q15911 3703 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MED13LQ71F56 2210 aa21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 E9PBE3 544 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF195O14628 629 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 UGT2B17O75795 530 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNGR4O95473 234 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 OR12D1P0DN82 309 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 UBL4AP11441 157 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ELK4P28324 431 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SKP2Q13309 424 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF141Q15928 474 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MAPK14Q16539 360 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SAXO2Q658L1 398 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 OR6K3Q8NGY3 331 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 OR5W2Q8NH69 310 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MBD6Q96DN6 1003 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 MARK4Q96L34 752 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC39A3Q9BRY0 314 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 COQ10BQ9H8M1 238 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-204ENST00000528201 DUXAA6NLW8 204 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 C16orf97H3BN30 126 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 CASKO14936 926 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF264O43296 627 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 STX11O75558 287 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 RAF1P04049 648 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 UQCRC2P22695 453 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ADH6P28332 368 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 EPHA3P29320 983 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNJ5P48544 419 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 CARD18P57730 90 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 QPRTQ15274 297 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 TLCD1Q96CP7 247 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 EMC9Q9Y3B6 208 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.38■■□□□ 1.01
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