RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	NYAP2	Q9P242	653 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	EMCN	Q9ULC0	261 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	OR1A2	Q9Y585	309 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PCM1-223	ENST00000524356	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		3.78	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PARP14	Q460N5	1801 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ESYT2	A0FGR8	921 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF732	B4DXR9	585 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356		C9JVG2	144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TULP2	O00295	520 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF197	O14709	1029 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	DUX1	O43812	170 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CBR3	O75828	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	KLHL2	O95198	593 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ANP32D	O95626	131 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PRKAR1A	P10644	381 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	GNLY	P22749	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SFTPD	P35247	375 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RORA	P35398	523 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	OR3A3	P47888	321 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SELENOV	P59797	346 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	IRF8	Q02556	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TAF10	Q12962	218 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ILK	Q13418	452 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	NCF4	Q15080	339 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TGFBI	Q15582	683 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	EXT1	Q16394	746 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CDKN3	Q16667	212 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	AMZ1	Q400G9	498 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	MLIP	Q5VWP3	458 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RTL6	Q6ICC9	239 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	OR2A2	Q6IF42	318 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1328	Q86T90	577 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RAB1C	Q92928	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	LRRC45	Q96CN5	670 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	TGM7	Q96PF1	710 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	KRT12	Q99456	494 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	IL22	Q9GZX6	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RHBG	Q9H310	441 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	AZI2	Q9H6S1	392 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	RNF121	Q9H920	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FZD3	Q9NPG1	666 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	MYO6	Q9UM54	1294 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	SATB2	Q9UPW6	733 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PPV4	95 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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