RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GJE1A6NN92 205 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 OIP5O43482 229 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 THBDP07204 575 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ATP12AP54707 1039 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 HBA1P69905 142 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BEX5Q5H9J7 111 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 OR5D16Q8NGK9 328 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO27Q8NI29 283 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.03■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 INHBBP09529 407 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 C21orf58P58505 322 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ABHD3Q8WU67 409 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ROBO4Q8WZ75 1007 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ASIC5Q9NY37 505 aa22.02■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF195O14628 629 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 NID1P14543 1247 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PRKCAP17252 672 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN8P56748 225 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 EMX2Q04743 252 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PGS1Q32NB8 556 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZIM3Q96PE6 472 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SMR3AQ99954 134 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 OR10A4Q9H209 315 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.01■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 UBL4AP11441 157 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 CCR4P51679 360 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 NR1H2P55055 460 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SELENBP1Q13228 472 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SMU1Q2TAY7 513 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM201Q5SNT2 666 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 WDR93Q6P2C0 686 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 RFWD2Q8NHY2 731 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 GPR119Q8TDV5 335 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZFP90Q8TF47 636 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PERPQ96FX8 193 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35G5Q96KT7 338 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM109Q9BVC6 243 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 COQ10BQ9H8M1 238 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL13Q9P2N7 655 aa22■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF264O43296 627 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 KLF4O43474 513 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 EFNA2O43921 213 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 AK1P00568 194 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SERPINE1P05121 402 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 MATN1P21941 496 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 KRT71Q3SY84 523 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 OR4F3Q6IEY1 312 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 WFDC8Q8IUA0 241 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF781Q8N8C0 355 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 OR5W2Q8NH69 310 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SDF2Q99470 211 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 WDR91A4D1P6 747 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 DUXAA6NLW8 204 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ITM2AO43736 263 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SLC7A1P30825 629 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 CBFBQ13951 182 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 CHI3L2Q15782 390 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 FCRLAQ7L513 359 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 TUSC5Q8IXB3 177 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 ARSGQ96EG1 525 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 GP6Q9HCN6 339 aa21.98■■□□□ 1.11
ALYREF-203ENST00000511412 DSCAMO60469 2012 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms