RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC1A5	Q15758	541 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF77	Q15935	545 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HAGH	Q16775	308 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	COX19	Q49B96	90 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIQK	Q629K1	86 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OGFOD2	Q6N063	350 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	XKRX	Q6PP77	449 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HSDL2	Q6YN16	418 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	LACC1	Q8IV20	430 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PGBD5	Q8N414	524 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	HM13	Q8TCT9	377 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF398	Q8TD17	642 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MZB1	Q8WU39	189 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SMPDL3A	Q92484	453 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OTULIN	Q96BN8	352 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DUX5	Q96PT3	197 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR14A2	Q96R54	314 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NOTCH4	Q99466	2003 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TLE6	Q9H808	572 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DYRK4	Q9NR20	520 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXL17	Q9UF56	701 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNK6	Q9Y257	313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PCNT	O95613	3336 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PPC1	479 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CD160	O95971	181 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNA21	P01568	189 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FGF1	P05230	155 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	C1S	P09871	688 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	FDXR	P22570	491 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PTGER4	P35408	488 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PNLIPRP2	P54317	469 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	MLLT10	P55197	1068 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP2CB	P62714	309 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP2CA	P67775	309 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC18A2	Q05940	514 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	AQP6	Q13520	282 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TDG	Q13569	410 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL6IP1	Q15041	203 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	RBBP7	Q16576	425 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	NRN1L	Q496H8	165 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	PIGG	Q5H8A4	983 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	SPRED2	Q7Z698	418 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	KLB	Q86Z14	1044 aa		6.28	□□□□□ -1.4
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.28	□□□□□ -1.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms