RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502715.1

UBE2CP3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP3, Length 450 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP3-201ENST00000502715 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
UBE2CP3-201ENST00000502715 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCDC88CQ9P219 2028 aa3.59□□□□□ -1.83
UBE2CP3-201ENST00000502715 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SVILO95425 2214 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 A0A1W2PQ72 361 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 A6NL46 340 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CLCA1A8K7I4 914 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 H3BUI4 141 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 K7EQM0 130 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PEX12O00623 359 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 MAP2K7O14733 419 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PFDN6O15212 129 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZNF185O15231 689 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC16A6O15403 523 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZSCAN12O43309 604 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 KCNAB3O43448 404 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 NDUFA2O43678 99 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 AVILO75366 819 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 DHFRP00374 187 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 MBP02144 154 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 GSTT2P0CG29 244 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 GSTT2BP0CG30 244 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 GP1BBP13224 206 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 POU1F1P28069 291 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PSMB5P28074 263 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 FMO4P31512 558 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CD79BP40259 229 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CDKN2CP42773 168 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC1A2P43004 574 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ETV4P43268 484 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 UQCRFS1P47985 274 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 LIMS1P48059 325 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 MEOX1P50221 254 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 BCAP31P51572 246 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ARFIP2P53365 341 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 FOXL2P58012 376 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SPCS3P61009 180 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 RELAQ04206 551 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 OCA2Q04671 838 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 MGAT2Q10469 447 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 TP53BP2Q13625 1128 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IRF3Q14653 427 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 GRM7Q14831 915 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PCLAFQ15004 111 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRTGQ2VWP7 1150 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IFI44LQ53G44 452 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PRR31Q5SQ13 230 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 MLIPQ5VWP3 458 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 Q6ZS92 163 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 TTLL10Q6ZVT0 673 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CENPUQ71F23 418 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CUZD1Q86UP6 607 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 PLD3Q8IV08 490 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC15A4Q8N697 577 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 DTD1Q8TEA8 209 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.58□□□□□ -1.84
UBE2CP3-201ENST00000502715 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms