RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PSMG1O95456 288 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ANP32DO95626 131 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ITGAMP11215 1152 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 UQCRC2P22695 453 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ITGA3P26006 1051 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ACVR2AP27037 513 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRDX6P30041 224 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EMDP50402 254 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CLCN2P51788 898 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF134P52741 427 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRKAG1P54619 331 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MFAP5Q13361 173 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TP53BP2Q13625 1128 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 INAQ16352 499 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MMEL1Q495T6 779 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PLA1AQ53H76 456 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 REP15Q6BDI9 236 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DPP10Q8N608 796 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 Q8NA96 180 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SFXN5Q8TD22 340 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TM9SF4Q92544 642 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 RCN3Q96D15 328 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NPAS2Q99743 824 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EQTNQ9NQ60 294 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRODH2Q9UF12 536 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CFL2Q9Y281 166 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 BSNQ9UPA5 3926 aa6.79□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 A8MUI8 341 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MRASO14807 208 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 AIM2O14862 343 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PTPN6P29350 595 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 LOXL3P58215 753 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GTDC1Q4AE62 458 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SAXO2Q658L1 398 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 Q6ZS92 163 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC5A8Q8N695 610 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NUBPLQ8TB37 319 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 NEURL3Q96EH8 262 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GIMAP5Q96F15 307 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 VSTM2LQ96N03 204 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 AGAP4Q96P64 663 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ITPAQ9BY32 194 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.78□□□□□ -1.32
GARNL3-222ENST00000498801 VAPAQ9P0L0 249 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms