RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 VNN3Q9NY84 501 aa6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 TLR4O00206 839 aa6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 SPINT1O43278 529 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 KIAA1024LP59773 190 aa6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 ACER2Q5QJU3 275 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 PARGQ86W56 976 aa6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.76□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 MPIP34949 423 aa6.75□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.75□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.75□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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ROBO1-211ENST00000498428 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.75□□□□□ -1.33
ROBO1-211ENST00000498428 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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