RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PDYN	P01213	254 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C2	P06681	752 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IL3	P08700	152 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A16	P16260	332 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MPI	P34949	423 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH9	Q5TGP6	573 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR7G2	Q8NG99	324 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF138	Q8WVD3	245 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	MUCL1	Q96DR8	90 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HBEGF	Q99075	208 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM2	Q9C040	744 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS11	Q9H270	941 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NFU1	Q9UMS0	254 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CR1	P17927	2039 aa		9.61	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WZY1	265 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LPK6	155 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DPRX	A6NFQ7	191 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PLOD3	O60568	738 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RAMP1	O60894	148 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM24	O75264	130 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL2	O95198	593 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	UTS2	O95399	124 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ADA	P00813	363 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CD8A	P01732	235 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTA2	P09210	222 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF17	P17021	662 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	STX2	P32856	288 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	THBS2	P35442	1172 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD18	P57730	90 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG6	Q00889	435 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DTX2	Q86UW9	622 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF525	Q8N782	197 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	HTRA1	Q92743	480 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OSTF1	Q92882	214 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DPH5	Q9H2P9	285 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	BRF2	Q9HAW0	419 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		9.6	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCD4	O14678	606 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TP73	O15350	636 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH7	O60245	1069 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0513	O60268	411 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH1	O95259	989 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IL33	O95760	270 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	OTC	P00480	354 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TYK2	P29597	1187 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SFTPD	P35247	375 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GZMK	P49863	264 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF3	Q13114	568 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGAD	Q13349	1161 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NAB1	Q13506	487 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SQLE	Q14534	574 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY6	Q15077	328 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	PPA1	Q15181	289 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM166A	Q6J272	317 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A25	Q6T423	547 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM107	Q6UX40	140 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	CYS1	Q717R9	158 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		9.59	□□□□□ -0.87
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87

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