RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GPRIN2	O60269	458 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SYP	P08247	313 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NAT1	P18440	290 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ETV5	P41161	510 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	EVX1	P49640	407 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CTSC	P53634	463 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	STK11	Q15831	433 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LAMB1	P07942	1786 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TAF1	P21675	1872 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574		H7C417	338 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CNMD	O75829	334 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PRR35	P0CG20	571 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ELK1	P19419	428 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	KCNJ5	P48544	419 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CAPZA1	P52907	286 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GPLD1	P80108	840 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ESX1	Q8N693	406 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	IFNA17	P01571	189 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PCMT1	P22061	227 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	CCR9	P51686	369 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		13.27	□□□□□ -0.28
PKD1-222	ENST00000496574	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC6A9	P48067	706 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CAMLG	P49069	296 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NRG3	P56975	720 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GPR50	Q13585	617 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IRF4	Q15306	451 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LNX2	Q8N448	690 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HSPA12A	O43301	675 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SIX6	O95475	246 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GP1BB	P13224	206 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CPE	P16870	476 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MMP11	P24347	488 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HYAL2	Q12891	473 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FADS1	O60427	444 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJB6	O75190	326 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SOD2	P04179	222 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF35	P13682	527 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	AMY2B	P19961	511 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RAB28	P51157	221 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ERVK-21	P61565	698 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CXADR	P78310	365 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ELP5	Q8TE02	316 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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