RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	VDAC1	P21796	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	GCK	P35557	465 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SLC26A2	P50443	739 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RAB40B	Q12829	278 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SYPL1	Q16563	259 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FGGY	Q96C11	551 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PAX7	P23759	505 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	HPCAL1	P37235	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	OR3A4P	P47883	348 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	LIM2	P55344	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PRR4	Q16378	134 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CITED1	Q99966	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305		Q9H3A6	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305		K7ENP7	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CPN1	P15169	458 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	HOXD10	P28358	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	NTS	P30990	170 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PPT1	P50897	306 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TXN2	Q99757	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TNR	Q92752	1358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305		E7ESA3	106 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	SULT2B1	O00204	365 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305		P0C879	139 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	UQCRC2	P22695	453 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	RGR	P47804	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	STAR	P49675	285 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PHF20-215	ENST00000496305	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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