RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	EFNA2	O43921	213 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	UGT2B17	O75795	530 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	IGKV3-11	P04433	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF853	P0CG23	659 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CALB2	P22676	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	PTGFR	P43088	359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	LIM2	P55344	173 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIP10	Q15642	601 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CHI3L2	Q15782	390 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ARSK	Q6UWY0	536 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615		Q8N9L7	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CNNM3	Q8NE01	707 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	KRT23	Q9C075	422 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ECT2	Q9H8V3	914 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	OARD1	Q9Y530	152 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	NCAPD2	Q15021	1401 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0J9YXY3	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	PANO1	I0J062	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CLDN5	O00501	218 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	SUPT7L	O94864	414 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	AKR7A3	O95154	331 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	SNAPIN	O95295	136 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	LALBA	P00709	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CSF2	P04141	144 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ASNS	P08243	561 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF17	P17021	662 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CD1B	P29016	333 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	MAGEA5	P43359	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	RABIF	P47224	123 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CEBPE	Q15744	281 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CNST	Q6PJW8	725 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	MYLPF	Q96A32	169 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	CITED1	Q99966	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CBWD5-231	ENST00000495615	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1B0GUA9	196 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	SULT2B1	O00204	365 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	FCN1	O00602	326 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	PRPSAP2	O60256	369 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	HCN1	O60741	890 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	ECI2	O75521	394 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	HTR1E	P28566	365 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	LAGE3	Q14657	143 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	MAPK6	Q16659	721 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	M1AP	Q8TC57	530 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	MCHR1	Q99705	422 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	NRTN	Q99748	197 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0U1RQV5	110 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	GSAP	A4D1B5	854 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615		E7ESA3	106 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615		H3BMQ9	156 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	OPN1LW	P04000	364 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	FUT1	P19526	365 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	ADRA1A	P35348	466 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	NUP107	P57740	925 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	MECOM	Q03112	1051 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	RAB40B	Q12829	278 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CBWD5-231	ENST00000495615	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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