RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 TEAD1P28347 426 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 FAUP35544 74 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 XCR1P46094 333 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2L5Q8NG80 312 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PEX11GQ96HA9 241 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 HHIPQ96QV1 700 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 S100A13Q99584 98 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.56□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 RBBP9O75884 186 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CSTAP01040 98 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CBR1P16152 277 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PDX1P52945 283 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 IFITM2Q01629 132 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 LCN10Q6JVE6 187 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SRRQ9GZT4 340 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PEX12O00623 359 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CCSO14618 274 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SCO2O43819 266 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CD160O95971 181 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ADRB3P13945 408 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 E2F1Q01094 437 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 GALNT7Q86SF2 657 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 DERL3Q96Q80 235 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR7D2Q96RA2 312 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 LGR4Q9BXB1 951 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PHIPQ8WWQ0 1821 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0A6YYJ9 748 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR14I1A6ND48 311 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PRH1P02810 166 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 TCRBP04435 133 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 MVDP53602 400 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SORDQ00796 357 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PLK5Q496M5 336 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 LEG1Q6P5S2 330 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 NMNAT3Q96T66 252 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CHST8Q9H2A9 424 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 DIABLOQ9NR28 239 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.55□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CDHR4A6H8M9 788 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA0355O15063 1070 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 HCRTR2O43614 444 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 RP2O75695 350 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 AIFM1O95831 613 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 IL1AP01583 271 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SFTPBP07988 381 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PPM1AP35813 382 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 GDNFP39905 211 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PRKXP51817 358 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 AP3S2P59780 193 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 NDUFA9Q16795 377 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM163Q8TC26 289 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PATE1Q8WXA2 126 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 NXPE2Q96DL1 559 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 CALML5Q9NZT1 146 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 URADA6NGE7 173 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 EMC8O43402 210 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 KLK8O60259 260 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS4O75173 837 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 ACP2P11117 423 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 IGFBP4P22692 258 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 PITPNAQ00169 270 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 GALK2Q01415 458 aa11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TRIOBP-211ENST00000492485 OR56A1Q8NGH5 318 aa11.54□□□□□ -0.56
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