RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	DCTN3	O75935	186 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CRYZL1	O95825	349 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GYPC	P04921	128 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CETP	P11597	493 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANXA13	P27216	316 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GNA11	P29992	359 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CDR2	Q01850	454 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ASPH	Q12797	758 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	KRT81	Q14533	505 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPK11	Q15759	364 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TIGIT	Q495A1	244 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ASRGL1	Q7L266	308 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LINC00523	Q86TU6	105 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MMD2	Q8IY49	270 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		Q9H521	79 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SGK2	Q9HBY8	427 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF175	Q9Y473	711 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	COX11	Q9Y6N1	276 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MYH8	P13535	1937 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A075B6Q4	140 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	FUOM	A2VDF0	154 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UNC119B	A6NIH7	251 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PP2D1	A8MPX8	630 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS14	O43566	566 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZFAND5	O76080	213 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	VAPB	O95292	243 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CLPTM1	O96005	669 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SERPINA3	P01011	423 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC1A1	P43005	524 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DNA2	P51530	1060 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	IST1	P53990	364 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	STX17	P56962	302 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NUP107	P57740	925 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SERTAD2	Q14140	314 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	HERC3	Q15034	1050 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RAET1L	Q5VY80	246 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF790	Q6PG37	636 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C4orf22	Q6V702	233 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	LSMEM2	Q8N112	164 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	BORCS5	Q969J3	196 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC35C1	Q96A29	364 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PHF21A	Q96BD5	680 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PYCR2	Q96C36	320 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	C8orf44	Q96CB5	159 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MSANTD3	Q96H12	275 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TXNDC15	Q96J42	360 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A1B0GUH1	482 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	UGDH	O60701	494 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	SPAG7	O75391	227 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ZMPSTE24	O75844	475 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PSMG1	O95456	288 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	H2BFM	P0C1H6	154 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GFAP	P14136	432 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GPX3	P22352	226 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	ACKR3	P25106	362 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PIGA	P37287	484 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DSTN	P60981	165 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	PLD1	Q13393	1074 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	GTF2H2	Q13888	395 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	OPCML	Q14982	345 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	CALCRL	Q16602	461 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	RGS21	Q2M5E4	152 aa		2.55	□□□□□ -2
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM16L	Q309B1	348 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms