RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NDC1Q9BTX1 674 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 AMBNQ9NP70 447 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 LRP4O75096 1905 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 F5P12259 2224 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TRANK1O15050 2925 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 A0A075B6Q4 140 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 METTL15A6NJ78 407 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR6C76A6NM76 312 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC30A4O14863 429 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SURF4O15260 269 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PFDN1O60925 122 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR2B3O76000 313 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 IFNA16P05015 189 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TSPAN19P0C672 248 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GAAP10253 952 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CPEP16870 476 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CD53P19397 219 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 S1PR1P21453 382 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GADD45AP24522 165 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC6A6P31641 620 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RORAP35398 523 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OPRL1P41146 370 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PPICP45877 212 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PPP5CP53041 499 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1CAP62136 330 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PSG6Q00889 435 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 BNC1Q01954 994 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 BDH1Q02338 343 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RUNX1T1Q06455 604 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ACSM1Q08AH1 577 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 GPR50Q13585 617 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 FGFBP1Q14512 234 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CCNJQ5T5M9 372 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 KIF18BQ86Y91 864 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SIX5Q8N196 739 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC15A4Q8N697 577 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR52N1Q8NH53 320 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR4C6Q8NH72 309 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NDNFQ8TB73 568 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 FANK1Q8TC84 345 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PIK3R3Q92569 461 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 FGF11Q92914 225 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 RNFT2Q96EX2 444 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 OR10A5Q9H207 317 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-243ENST00000488923 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.12□□□□□ -1.43
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