RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PDPK1O15530 556 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 EMC8O43402 210 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SLITRK5O94991 958 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 INHBBP09529 407 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CRYGSP22914 178 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 GPC1P35052 558 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K8P41279 467 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CLDN8P56748 225 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 C21orf58P58505 322 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PRR5P85299 388 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 AGKQ53H12 422 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 Q5PR19 223 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SZRD1Q7Z422 152 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 BIVMQ86UB2 503 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 RIMKLAQ8IXN7 391 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 GIMAP5Q96F15 307 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 DPY30Q9C005 99 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ZNF175Q9Y473 711 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 C16orf97H3BN30 126 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A3O75751 556 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 UBOX5O94941 541 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 NKX2-2O95096 273 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 KCNH1O95259 989 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 THBDP07204 575 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ASMTP46597 345 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SGCBQ16585 318 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-212ENST00000485532 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 IKBIPQ70UQ0 350 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 NUP43Q8NFH3 380 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 MRGBPQ9NV56 204 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PROCRQ9UNN8 238 aa11.32□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.32□□□□□ -0.6
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PRAME-212ENST00000485532 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 FAM234BA2RU67 622 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 H7C1Q1 480 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 NR5A2O00482 541 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CXCL13O43927 109 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SMPD2O60906 423 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 KCNK2O95069 426 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 LY6G6DO95868 133 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CD8BP10966 210 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 IL11P20809 199 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PRPS1L1P21108 318 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 HPCAL1P37235 193 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PDE7AQ13946 482 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 KRT72Q14CN4 511 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ACKR1Q16570 336 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 DUSP5Q16690 384 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SHEQ5VZ18 495 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 SNX32Q86XE0 403 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 P3H2Q8IVL5 708 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 OR10D3Q8NH80 312 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 TESCQ96BS2 214 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PPCDCQ96CD2 204 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PERPQ96FX8 193 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ADGRG7Q96K78 797 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 Q96MF0 132 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 RNF145Q96MT1 663 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB18Q99592 522 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 CCL19Q99731 98 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.31□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 REEP4Q9H6H4 257 aa11.31□□□□□ -0.6
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