RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 FUT5Q11128 374 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PLXDC2Q6UX71 529 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FRRS1Q6ZNA5 592 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FUNDC1Q8IVP5 155 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKFN1Q8N957 763 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5W2Q8NH69 310 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR119Q8TDV5 335 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 RAD21L1Q9H4I0 556 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A13Q9NSD5 602 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 P2RX2Q9UBL9 471 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNE5Q9UJ90 142 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PKDREJQ9NTG1 2253 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC22A20A6NK97 555 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YC42 278 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP8B1O43520 1251 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 IL18BPO95998 194 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 LINGO3P0C6S8 592 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ADH6P28332 368 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN15P56746 228 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 DSTNP60981 165 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TFF3Q07654 80 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FGFBP1Q14512 234 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPK14Q16539 360 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GTDC1Q4AE62 458 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2A2Q6IF42 318 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP4R4Q6NUP7 873 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MCEMP1Q8IX19 187 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO27Q8NI29 283 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 POC1BQ8TC44 478 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 NPAS1Q99742 590 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PRRG4Q9BZD6 226 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CALML5Q9NZT1 146 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A096LPI6 279 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CLIC1O00299 241 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TGM6O95932 706 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 OPN1LWP04000 364 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ETFAP13804 333 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PGCP20142 388 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ASCL1P50553 236 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ10P78508 379 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXF1Q12946 379 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GNA13Q14344 377 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 LILRA2Q8N149 483 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL25Q8N6Q8 603 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PMM1Q92871 262 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ZG16BQ96DA0 208 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ARSGQ96EG1 525 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SFXN3Q9BWM7 321 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GJE1A6NN92 205 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRM4P08173 479 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 IL7RP16871 459 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ELK4P28324 431 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 UQCRC1P31930 480 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PON3Q15166 354 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 QPRTQ15274 297 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL21CQ5VZV1 264 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GDF7Q7Z4P5 450 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 HMGN2P46Q86SG4 172 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GGNQ86UU5 652 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PEX5LQ8IYB4 626 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 GCNT2Q8N0V5 402 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF563Q8TA94 476 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM234Q8WY98 164 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FIG4Q92562 907 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MRGPRX4Q96LA9 322 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM185BQ9H7F4 350 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms