RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF525Q8N782 197 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 C3orf56Q8N813 242 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP43Q8NFH3 380 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM110BQ8TC76 370 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NOTCH1P46531 2555 aa8.36□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SCDO00767 359 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 OIP5O43482 229 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 EFNA2O43921 213 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC22BO75396 215 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CD8AP01732 235 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PROCP04070 461 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CD3EP07766 207 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 UROSP10746 265 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HPGDP15428 266 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SDC1P18827 310 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HNF1AP20823 631 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ADH6P28332 368 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 LCN1P31025 176 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF117Q03924 483 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 BSPH1Q075Z2 132 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PDE7AQ13946 482 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PDSS1Q5T2R2 415 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CCNJQ5T5M9 372 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 COX18Q8N8Q8 333 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MZB1Q8WU39 189 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PPCDCQ96CD2 204 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC126Q96EE4 140 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FCRL1Q96LA6 429 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TSSK3Q96PN8 268 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CCT7Q99832 543 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 REEP4Q9H6H4 257 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 NGBQ9NPG2 151 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TIGARQ9NQ88 270 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf109Q9NX04 203 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.35□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PQD3 144 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BQF6 201 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 RIPK2O43353 540 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TBX19O60806 448 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAP00813 363 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ALOX5P09917 674 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PRPH2P23942 346 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ELK4P28324 431 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINB4P48594 390 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJB13P59910 316 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTG1P63261 375 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RY6Q15077 328 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 MIDNQ504T8 468 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CFAP157Q5JU67 520 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 CBLN3Q6UW01 205 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 FCRLAQ7L513 359 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 BANPQ8N9N5 519 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOA3Q8NG57 546 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2T11Q8NH01 316 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD17B8Q92506 261 aa8.34□□□□□ -1.07
SMARCE1-210ENST00000481231 JADE3Q92613 823 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms