RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 UQCRC2P22695 453 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PTPN6P29350 595 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NOS3P29474 1203 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HOXC8P31273 242 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 S100A3P33764 101 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CTNNB1P35222 781 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PCGF2P35227 344 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ETV5P41161 510 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PCP4P48539 62 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCNJ3P48549 501 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 XKP51811 444 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PLK1P53350 603 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LGALS4P56470 323 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NRG3P56975 720 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SMIM11AP58511 58 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZP1P60852 638 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SELENOWP63302 87 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MALLQ13021 153 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MTAPQ13126 283 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR2F1Q13607 317 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF626Q68DY1 528 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CASP12Q6UXS9 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 USP30Q70CQ3 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GAREM2Q75VX8 874 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NAA40Q86UY6 237 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KLBQ86Z14 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 Q8N1Y9 231 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 IFI44Q8TCB0 444 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 UBE2FQ969M7 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAB3CQ96E17 227 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C14orf144Q96I85 54 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRFN5Q96NI6 719 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCNC2Q96PR1 638 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NPY6RQ99463 290 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DUSP16Q9BY84 665 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 POFUT1Q9H488 388 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BCO1Q9HAY6 547 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SERHLQ9NQF3 203 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF302Q9NR11 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CALML5Q9NZT1 146 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRFN1Q9P244 771 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CA14Q9ULX7 337 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPC1 479 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPC4 97 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PQY0 241 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 A6NLC8 198 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 COLCA2A8K830 154 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRRN3E7EW58 273 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TLR4O00206 839 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TCAPO15273 167 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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