RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 LINGO4Q6UY18 593 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 DEF8Q6ZN54 512 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CALHM1Q8IU99 346 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF480Q8WV37 535 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM239Q8WW34 195 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NSMAFQ92636 917 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RIT1Q92963 219 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC25A28Q96A46 364 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RSG1Q9BU20 258 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NFU1Q9UMS0 254 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 IRAK3Q9Y616 596 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PQ27 194 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PQ64 194 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PQC6 194 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PR77 199 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 AGAP5A6NIR3 686 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 H3BQF6 201 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 M0QYV0 167 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 M0R082 166 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ACOT7O00154 380 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RFXANKO14593 260 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RS1O15537 224 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 DHHO43323 396 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CST1P01037 141 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLURP2P0DP57 97 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 UCHL3P15374 230 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 KCNE1P15382 129 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CYP11B1P15538 503 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 IGFBP2P18065 325 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PGAM1P18669 254 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 UQCRC2P22695 453 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ECHS1P30084 290 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR1D2P34982 312 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TIMP3P35625 211 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NPBWR2P48146 333 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 IRX4P78413 519 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MC2RQ01718 297 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 DHODHQ02127 395 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FOLH1Q04609 750 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 FUT7Q11130 342 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 GPNMBQ14956 572 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MICBQ29980 383 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 VWC2Q2TAL6 325 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 EMBQ6PCB8 327 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CBLN3Q6UW01 205 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CENPUQ71F23 418 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PIM3Q86V86 326 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 CACUL1Q86Y37 369 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 MTURNQ8N3F0 131 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 Q8N402 240 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PXT1Q8NFP0 134 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SNX33Q8WV41 574 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SMIM12Q96EX1 92 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2V2Q96R30 315 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINI1Q99574 410 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 IL12RB2Q99665 862 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 SYT11Q9BT88 431 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 C1orf198Q9H425 327 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCE1-208ENST00000474246 RHOFQ9HBH0 211 aa5.63□□□□□ -1.51
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