RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 AFMIDQ63HM1 303 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SCD5Q86SK9 330 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 HGDQ93099 445 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 KCNJ15Q99712 375 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SHPKQ9UHJ6 478 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PRAMEF25A6NGN4 478 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ACP5P13686 325 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 EDNRBP24530 442 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NPBWR1P48145 328 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 WNT3P56703 355 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OR4C15Q8NGM1 316 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OR51A7Q8NH64 312 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NUBPLQ8TB37 319 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TMED6Q8WW62 240 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SLC25A28Q96A46 364 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 POM121Q96HA1 1249 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 MGME1Q9BQP7 344 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.93□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ACOD1A6NK06 481 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NDUFA6P56556 154 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NFATC2Q13469 925 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NFATC4Q14934 902 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 UBXN11Q5T124 520 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TEX26Q8N6G2 289 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 DOK4Q8TEW6 326 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SLC38A5Q8WUX1 472 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 GHSRQ92847 366 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TBC1D20Q96BZ9 403 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 GKN1Q9NS71 199 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 IDSP22304 550 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 E2F1Q01094 437 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 RPE65Q16518 533 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NKPD1Q17RQ9 610 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TINAGQ9UJW2 476 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 MAFFQ9ULX9 164 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 URADA6NGE7 173 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 MAGEB1P43366 347 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PRKXP51817 358 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 HCCSP53701 268 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OR12D2P58182 307 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CHAF1BQ13112 559 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ACER2Q5QJU3 275 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 MED27Q6P2C8 311 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ABHD4Q8TB40 342 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 THAP4Q8WY91 577 aa13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 K7ERQ8 282 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SYT5O00445 386 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ICOSLGO75144 302 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ETHE1O95571 254 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 IFNGR1P15260 489 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CTNNB1P35222 781 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 EIF1P41567 113 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CRYBA2P53672 197 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 SSTP61278 116 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NUDT13Q86X67 352 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 NRMQ8IXM6 262 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 PLPP6Q8IY26 295 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OR6V1Q8N148 313 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 ARMC10Q8N2F6 343 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 IL17RCQ8NAC3 791 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 AVL9Q8NBF6 648 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 OSER1Q9NX31 292 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM129A0AVI4 362 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CATP04040 527 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 CKMP06732 381 aa13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SOGA3-201ENST00000465909 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms