RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PARL	Q9H300	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TECPR2	O15040	1411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HELT	A6NFD8	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378		E7EWF7	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	BTN3A3	O00478	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TM9SF1	O15321	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF432	O94892	652 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PGC	P20142	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNC	P24863	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	AP3M2	P53677	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	MFAP2	P55001	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNA1	P78396	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF146	Q15072	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SSX2	Q16385	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM3C	Q92520	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	COQ2	Q96H96	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TYROBP	O43914	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	LRAT	O95237	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHG1	P01857	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	IGF1	P05019	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	HBQ1	P09105	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PNMT	P11086	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SFTPC	P11686	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	LAP3	P28838	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	GNPDA1	P46926	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	PIGC	Q92535	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBBP4-208	ENST00000463378	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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