RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CSO75390 466 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BCL10O95999 233 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN19P0C672 248 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GKN3PP0CG01 181 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GAAP10253 952 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A5P22732 501 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NR4A1P22736 598 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MST1P26927 711 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PSMB9P28065 219 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 POU1F1P28069 291 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LCN1P31025 176 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IDUAP35475 653 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TGFBR1P36897 503 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OPRL1P41146 370 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PPICP45877 212 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPR4P46093 362 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPR143P51810 404 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SMSP52788 366 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ATP12AP54707 1039 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 VBP1P61758 197 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RAB40BQ12829 278 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SKP2Q13309 424 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LNX2Q8N448 690 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BCORP1Q8N888 145 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C3Q8NH37 302 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C6Q8NH72 309 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF721Q8TF20 911 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM239Q8WW34 195 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TM9SF4Q92544 642 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OSTF1Q92882 214 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TSLPQ969D9 159 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF524Q96C55 264 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM80Q96HE8 168 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LRR1Q96L50 414 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DGAT2Q96PD7 388 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LMF1Q96S06 567 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DDOQ99489 341 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MGLLQ99685 303 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM2Q9C040 744 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR10A5Q9H207 317 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FN3KQ9H479 309 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 VCANP13611 3396 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GX78 115 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PQM1 296 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC182A6NF36 153 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FRG2CA6NGY1 282 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SERINC4A6NH21 518 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 UNC119BA6NIH7 251 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 H3BN98 237 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN4O14493 209 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR10H2O60403 315 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN2O60636 221 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPX5O75715 221 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR2B3O76000 313 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 IL33O95760 270 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BMP4P12644 408 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MYF5P13349 255 aa5.19□□□□□ -1.58
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