RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445609.6

NPHP1-207, Transcript of nephrocystin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP1, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1-207ENST00000445609 HTR2AP28223 471 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PEX2P28328 305 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CD96P40200 585 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PTGDSP41222 190 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SLC6A8P48029 635 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CCR4P51679 360 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ST3GAL3Q11203 375 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 GK3PQ14409 553 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR1Q1Q15612 314 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 MDGA2Q7Z553 956 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SVOPLQ8N434 492 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ARSGQ96EG1 525 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 LRFN1Q9P244 771 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 A0A1W2PRQ8 180 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 C17orf51A8MQB3 221 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 G3V2T6 193 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 WDPCPO95876 746 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 P04436 131 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 P2RX1P51575 399 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 COPZ1P61923 177 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TUBA3CQ13748 450 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 DGCR6Q14129 220 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 BROXQ5VW32 411 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ZNF613Q6PF04 617 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR5W2Q8NH69 310 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 NRBF2Q96F24 287 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 VCX3BQ9H321 246 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.7□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 FAAHO00519 579 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 F10P00742 488 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 THRBP10828 461 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 FUT4P22083 530 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 MSX1P28360 303 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 LIMS1P48059 325 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TLE3Q04726 772 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 MFAP5Q13361 173 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CBFBQ13951 182 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 STK32CQ86UX6 486 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CADM2Q8N3J6 435 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 FRMD6Q96NE9 622 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PDLIM1O00151 329 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PEX1O43933 1283 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 GMFGO60234 142 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SNX4O95219 450 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 NUDT14O95848 222 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 PGCP20142 388 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 VHLP40337 213 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 TRAM2Q15035 370 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 OR1C1Q15619 314 aa8.69□□□□□ -1.02
NPHP1-207ENST00000445609 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms