RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429774.6

ATXN3-204, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 6,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-204ENST00000429774 IFNA6P05013 189 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CD2P06729 351 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SLC6A8P48029 635 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FBXL6Q8N531 539 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MED30Q96HR3 178 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 A0A1W2PPK0 400 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PATE3B3GLJ2 98 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 J3KTA2 159 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SPATS1Q496A3 300 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ABCB7O75027 752 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ADAM23O75077 832 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 UTS2O95399 124 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CDKN2CP42773 168 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 AP3S2P59780 193 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PITPNAQ00169 270 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 NPRL3Q12980 569 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FZD2Q14332 565 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 KCNJ8Q15842 424 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SYPL1Q16563 259 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TEX19Q8NA77 164 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TSPEARQ8WU66 669 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 HAVCR1Q96D42 359 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SAMD8Q96LT4 415 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 THSD1Q9NS62 852 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 GPR83Q9NYM4 423 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PIAS2O75928 621 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CKMT1AP12532 417 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ZNF404Q494X3 552 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MARCH3Q86UD3 253 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PGAM5Q96HS1 289 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 LYSMD1Q96S90 227 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 H0YIV9 168 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 L7N2F9 121 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MOSPD3O75425 235 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 DDAH2O95865 285 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 RHDQ02161 417 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ECH1Q13011 328 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 OPN5Q6U736 354 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SHFQ7M4L6 423 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 OR5J2Q8NH18 312 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 NRG4Q8WWG1 115 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.63□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FAM166BA8MTA8 275 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 FLRT2O43155 660 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 SUSD5O60279 629 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 PCGF2P35227 344 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 KCNAB2Q13303 367 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 ALG10Q5BKT4 473 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 MED25Q71SY5 747 aa6.62□□□□□ -1.35
ATXN3-204ENST00000429774 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms