RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB38P57729 211 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACY1Q03154 408 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAB1Q15750 504 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR19Q15760 415 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LYPD8Q6UX82 237 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSDL2Q6YN16 418 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP53Q70EK8 1073 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED25Q71SY5 747 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR135Q8IZ08 494 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF175Q8N4F7 328 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 NR4A3Q92570 626 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF607Q96SK3 696 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASPNQ9BXN1 380 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PISDQ9UG56 409 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 DAPP1Q9UN19 280 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIPT1Q9Y234 373 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.27□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HYKKA2RU49 373 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FITM1A5D6W6 292 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 C5orf58C9J3I9 102 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 EMC8O43402 210 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 C6orf47O95873 294 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 AK1P00568 194 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALAS2P22557 587 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GALNSP34059 522 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 KHKP50053 298 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HBA1P69905 142 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLIN5Q00G26 463 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAB21L1Q13394 359 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERTAD2Q14140 314 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAK1Q16611 211 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GTDC1Q4AE62 458 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TOR2AQ5JU69 321 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLET1Q6UQ28 207 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR151Q8TDV0 419 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OMA1Q96E52 524 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM80Q96HE8 168 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 C7orf34Q96L11 122 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LHX9Q9NQ69 397 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 IMPAD1Q9NX62 359 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A087WV62 115 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RGS5O15539 181 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMPRSS11DO60235 418 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTSVO60911 334 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH3BGRLO75368 114 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC43A1O75387 559 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPX5O75715 221 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYC1P08574 325 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TYRP1P17643 537 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL32P24001 234 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTGS2P35354 604 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SOAT1P35610 550 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TALDO1P37837 337 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRATP43155 626 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP2K3P46734 347 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDC42P60953 191 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 DSTNP60981 165 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD83Q01151 205 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LAPTM4AQ15012 233 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms