RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GWA3 101 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A6NL46 340 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 G3V3Y1 287 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ALPLP05186 524 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ITPKBP27987 946 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 IFNA8P32881 189 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 DAPP51397 102 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ST3GAL3Q11203 375 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TRAM2Q15035 370 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 H3F3CQ6NXT2 135 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TMEM255BQ8WV15 326 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TTC9Q92623 222 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 HPF1Q9NWY4 346 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.25■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PRQ8 180 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TP53I11O14683 189 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 GNB5O14775 395 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PIP5K1CO60331 668 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OR10H3O60404 316 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FMO6PO60774 539 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SNAP29O95721 258 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NUDT14O95848 222 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LINGO3P0C6S8 592 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 POU2F1P14859 743 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 DGCR6Q14129 220 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TAF11Q15544 211 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NRBF2Q96F24 287 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF597Q96LX8 424 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FEVQ99581 238 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FUZQ9BT04 418 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LAT2Q9GZY6 243 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FAAHO00519 579 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 DLGAP1O14490 977 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 KLK10O43240 276 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LYPD3O95274 346 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CCL3P10147 92 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 IGFBP5P24593 272 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PTGDSP41222 190 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 HMGA2P52926 109 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 KCNAB2Q13303 367 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 MEP1AQ16819 746 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NR4A3Q92570 626 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FGF11Q92914 225 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF524Q96C55 264 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TRIM2Q9C040 744 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LHPPQ9H008 270 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 EVA1AQ9H8M9 152 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 USE1Q9NZ43 259 aa16.24■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A0A0B4J2E0 115 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GX12 115 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 HPRP00739 348 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 THRBP10828 461 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CASP3P42574 277 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 GAS1P54826 345 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 COPZ1P61923 177 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 CDC20Q12834 499 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 FAHD1Q6P587 224 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ZNF563Q8TA94 476 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SLC38A4Q969I6 547 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 SLC35B4Q969S0 331 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.23■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WUU8 490 aa16.22■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 B4DXG7 233 aa16.22■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.22■□□□□ 0.19
LTV1-201ENST00000367576 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms