RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CLDND1Q9NY35 253 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CALML5Q9NZT1 146 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RASD1Q9Y272 281 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PRG6 482 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS38A1L453 326 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FGF17O60258 216 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ADH1BP00325 375 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CA3P07451 260 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SYPP08247 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CT62P0C5K7 136 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ARSBP15848 533 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 NT5EP21589 574 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 C5AR1P21730 350 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HLA-DMAP28067 261 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TEAD1P28347 426 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 THBS2P35442 1172 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HTR2BP41595 481 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FAPQ12884 760 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ADAM15Q13444 863 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CRMP1Q14194 572 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 GPR176Q14439 515 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DCST2Q5T1A1 773 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 MZT2AQ6P582 158 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 GJD3Q8N144 294 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PATE1Q8WXA2 126 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PTP4A1Q93096 173 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 C4orf36Q96KX1 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CD180Q99467 661 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KCNJ15Q99712 375 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TEX12Q9BXU0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ASB6Q9NWX5 421 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CDHR4A6H8M9 788 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IMPA2O14732 288 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ADAM11O75078 769 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TSC22D2O75157 780 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 HMGN1P05114 100 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CTSBP07858 339 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CPMP14384 443 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 COL9A1P20849 921 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 NDUFS1P28331 727 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 GDI1P31150 447 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR12D2P58182 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SHC2P98077 582 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FOXK2Q01167 660 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF85Q03923 595 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RGS1Q08116 209 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ACSM1Q08AH1 577 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC58Q4VC31 144 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FCRL6Q6DN72 434 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 KRT74Q7RTS7 529 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR2L13Q8N349 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 FRMD1Q8N878 549 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 COX18Q8N8Q8 333 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-202ENST00000342084 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms