RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 HEXBP07686 556 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 HPGDP15428 266 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 MASP1P48740 699 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 IRF3Q14653 427 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 NCF4Q15080 339 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 SLC34A3Q8N130 599 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 FGF11Q92914 225 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-202ENST00000338546 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PQD3 144 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 UNC119BA6NIH7 251 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IDSB3KWA1 339 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 H3BMQ9 156 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ENTPD6O75354 484 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 INMTO95050 263 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RCBTB2O95199 551 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TIAF1O95411 115 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IGF2P01344 180 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PNLIPRP2P54317 469 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 COPZ1P61923 177 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MC2RQ01718 297 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ST3GAL4Q11206 333 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NNATQ16517 81 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SNAPC1Q16533 368 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BMPERQ8N8U9 685 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMEM163Q8TC26 289 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 COG8Q96MW5 612 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 WDR54Q9H977 334 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 COL6A3P12111 3177 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TSPAN2O60636 221 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 UTS2O95399 124 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IFI30P13284 250 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MAP2K4P45985 399 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GPR4P46093 362 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EMP2P54851 167 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR2T33Q8NG76 320 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR8K3Q8NH51 312 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GPR83Q9NYM4 423 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MEN1O00255 615 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PRKYO43930 277 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PIP5K1CO60331 668 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 UBL4AP11441 157 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IL12BP29460 328 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC6A8P48029 635 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NUDT6P53370 316 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PGGHGQ32M88 737 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NUBPLQ8TB37 319 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 YIPF6Q96EC8 236 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LAT2Q9GZY6 243 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 DSN1Q9H410 356 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C12orf10Q9HB07 376 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 AMBNQ9NP70 447 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms