RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 IKZF1Q13422 519 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DOC2BQ14184 412 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 GPR155Q7Z3F1 870 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ADCK2Q7Z695 626 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FBXO17Q96EF6 278 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 F2RL3Q96RI0 385 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 M0R129 80 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 LYRM1O43325 122 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SH3BGRLO75368 114 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SCELO95171 688 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ADRB1P08588 477 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 GPX2P18283 190 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CDKN2CP42773 168 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DAPP51397 102 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CLDN20P56880 219 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 TAS2R50P59544 299 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL26Q53HC5 615 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 GHDCQ8N2G8 530 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 OR5T2Q8NGG2 359 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 OR5K1Q8NHB7 308 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 APH1BQ8WW43 257 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PPCDCQ96CD2 204 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CRELD1Q96HD1 420 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 OR51M1Q9H341 326 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC6A13Q9NSD5 602 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 A0A075B6Q4 140 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TXNL1O43396 289 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 HOXA6P31267 233 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 CXCL12P48061 93 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 MAZP56270 477 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 GPR18Q14330 331 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SLC5A12Q1EHB4 618 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL22Q53GT1 634 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 LUZP2Q86TE4 346 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD46Q86W74 232 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SVOPLQ8N434 492 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 OR2T4Q8NH00 348 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 OR10A6Q8NH74 314 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 RHOVQ96L33 236 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 MIXL1Q9H2W2 232 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 LHX9Q9NQ69 397 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SIT1Q9Y3P8 196 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 GPR37L1O60883 481 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 DNASE1P24855 282 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 FOXK2Q01167 660 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 HEPACAMQ14CZ8 416 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 ELOCQ15369 112 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 ACER2Q5QJU3 275 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 UBE3DQ7Z6J8 389 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 BVESQ8NE79 360 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 UCK1Q9HA47 277 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 FANCMQ8IYD8 2048 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 C1orf226A1L170 272 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 K7ESF4 209 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TLR4O00206 839 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 YY2O15391 372 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 C9P02748 559 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 IL1RNP18510 177 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 S100PP25815 95 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 INPP1P49441 399 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 SLC3A1Q07837 685 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 CHAF1BQ13112 559 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TSC22D1Q15714 1073 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 MZT2BQ6NZ67 158 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 USP53Q70EK8 1073 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 NAGSQ8N159 534 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 STX19Q8N4C7 294 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 FTMTQ8N4E7 242 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 NT5CQ8TCD5 201 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 NXPE2Q96DL1 559 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXA3-201ENST00000317201 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms