RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 MICU2Q8IYU8 434 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 OR5W2Q8NH69 310 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXD4-201ENST00000306324 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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HOXD4-201ENST00000306324 RYKP34925 604 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 RNF148Q8N7C7 305 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 MED17Q9NVC6 651 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 RELNP78509 3460 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GVC2 190 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 NPIPA3F8WFD2 350 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 GCKP35557 465 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CPOXP36551 454 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 RINLQ6ZS11 566 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SMYD1Q8NB12 490 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GPR119Q8TDV5 335 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SFXN2Q96NB2 322 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CDRT15Q96T59 188 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 A0A087WZY1 265 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GSTA4O15217 222 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 MFN2O95140 757 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 TPST1O60507 370 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SLC19A2O60779 497 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJA2O60884 412 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GKN3PP0CG01 181 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PGCP20142 388 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 AAGABQ6PD74 315 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF563Q8TA94 476 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB8AQ96BR9 441 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TAMM41Q96BW9 452 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SARAFQ96BY9 339 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PIGQQ9BRB3 760 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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HOXD4-201ENST00000306324 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 OR2M5A3KFT3 312 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 OR14I1A6ND48 311 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM11O75078 769 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TPOP07202 933 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 LINGO3P0C6S8 592 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 BMP7P18075 431 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A8P48029 635 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GFRA1P56159 465 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 QPRTQ15274 297 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FIG4Q92562 907 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 NPAS1Q99742 590 aa20.23■□□□□ 0.83
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