RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 SOCS6O14544 535 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 USP53Q70EK8 1073 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 OR5H6Q8NGV6 325 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 ZNF208O43345 1280 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 SFTPBP07988 381 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 EVI2BP34910 448 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 XCR1P46094 333 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 TMIEQ8NEW7 156 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 GPX5O75715 221 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 RAB11BQ15907 218 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 ALG10Q5BKT4 473 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 PTOV1Q86YD1 416 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 AVL9Q8NBF6 648 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 RCE1Q9Y256 329 aa20.33■□□□□ 0.85
USP12-201ENST00000282344 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TMEM205Q6UW68 189 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TMEM234Q8WY98 164 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 KCNJ13O60928 360 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SULT1C4O75897 302 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SPDEFO95238 335 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 PRR35P0CG20 571 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SQSTM1Q13501 440 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GKN2Q86XP6 184 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 AMDHD1Q96NU7 426 aa20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 M0R036 132 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SLC22A5O76082 557 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ETHE1O95571 254 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 FAM111BQ6SJ93 734 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GRK5P34947 590 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 P2RY2P41231 377 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SLC14A1Q13336 389 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 FAM189A2Q15884 450 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TEX46H3BTG2 121 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TMEM156Q8N614 296 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 FGF13Q92913 245 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 A0A0G2JMP0 313 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 K7ESM1 405 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 FZD7O75084 574 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ARSBP15848 533 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GALK2Q01415 458 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 CTF1Q16619 201 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 USP51Q70EK9 711 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SFXN5Q8TD22 340 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 AKR1C4P17516 323 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 PGCP20142 388 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 CLDN12P56749 244 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 STOML3Q8TAV4 291 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TM9SF4Q92544 642 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TAAR2Q9P1P5 351 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 OSGIN1Q9UJX0 560 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 PBX2P40425 430 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 MCM3APO60318 1980 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 GPR89BP0CG08 455 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 TRIM23P36406 574 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ACTBP60709 375 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 ACTG1P63261 375 aa20.31■□□□□ 0.84
USP12-201ENST00000282344 CTBSQ01459 385 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms