RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 RCBTB2O95199 551 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 POU2F1P14859 743 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FMO3P31513 532 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PCYT1AP49585 367 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF136P52737 540 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CTBP2P56545 445 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PPP1CAP62136 330 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 E2F1Q01094 437 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 RHAGQ02094 409 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PRKCDQ05655 676 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ST3GAL4Q11206 333 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DSG2Q14126 1118 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GPR68Q15743 365 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MOGQ16653 247 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 NAT6Q93015 286 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 VMP1Q96GC9 406 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PEX11GQ96HA9 241 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM80Q96HE8 168 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 LRFN5Q96NI6 719 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ITPAQ9BY32 194 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR10A5Q9H207 317 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FN3KQ9H479 309 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 STARD5Q9NSY2 213 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.85□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TNFSF15O95150 251 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GABARAPO95166 117 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 BCL10O95999 233 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CT62P0C5K7 136 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CAPZA2P47755 286 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 RAB40BQ12829 278 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 NFATC3Q12968 1075 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 GINS1Q14691 196 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR1Q1Q15612 314 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 AMZ1Q400G9 498 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ULK3Q6PHR2 472 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 VASH2Q86V25 355 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC103Q8IW40 242 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF527Q8NB42 609 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 TEX47Q8TBZ9 253 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FGF11Q92914 225 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 UBE2FQ969M7 185 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 DACH2Q96NX9 599 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 C12orf10Q9HB07 376 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 LANCL2Q9NS86 450 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CBLCQ9ULV8 474 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.84□□□□□ -0.83
CDCA3-201ENST00000229265 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1B0GX78 115 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TO15178 435 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 CHP2O43745 196 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 PPM1BO75688 479 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 MT-ND2P03891 347 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 NGFRP08138 427 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 BMP7P18075 431 aa9.83□□□□□ -0.84
CDCA3-201ENST00000229265 TNNI3P19429 210 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms