RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 APIPQ96GX9 242 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 H0YGG7 62 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GPR171O14626 319 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ENPP1P22413 925 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MISPQ8IVT2 679 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC18Q8N456 261 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NICN1Q9BSH3 213 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CNMDO75829 334 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ITGB8P26012 769 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 AGTR1P30556 359 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DLSTP36957 453 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CLDN17P56750 224 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R20P59543 309 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MSMO1Q15800 293 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MICAQ29983 383 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NEIL2Q969S2 332 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01553A4QN01 128 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SEC14L2O76054 403 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 FBXO45P0C2W1 286 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CPMP14384 443 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RAB38P57729 211 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ERVK-25P63136 954 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 EXT1Q16394 746 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DTX3Q8N9I9 347 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A18Q96N87 628 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 IP6K3Q96PC2 410 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 NME7Q9Y5B8 376 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CASC3O15234 703 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 SLC34A2O95436 690 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 DCTP40126 519 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CATR1Q13166 79 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 VWA2Q5GFL6 755 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 CD93Q9NPY3 652 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GV50 99 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RNF212BA8MTL3 300 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 M0R3H8 397 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 DVL2O14641 736 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HPRP00739 348 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS3P35030 304 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RAD52P43351 418 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 PTH2RP49190 550 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 GNB2P62879 340 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SQSTM1Q13501 440 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-201ENST00000220888 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms