RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 TPOP07202 933 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR2AP28223 471 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 DRD3P35462 400 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 VIPR2P41587 438 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPZA2P47755 286 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 BTN3A2P78410 334 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXK2Q01167 660 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL12Q53G59 568 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2L13Q8N349 312 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM239Q8WW34 195 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 C20orf141Q9NUB4 165 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF222Q9UK12 451 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CLTBP09497 229 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SBK2P0C263 348 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ACRP10323 421 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 M6PRP20645 277 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 MMP15P51511 669 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF85Q03923 595 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC3A1Q07837 685 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT33BQ14525 404 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 BMPERQ8N8U9 685 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 C17orf47Q8NEP4 570 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PFN4Q8NHR9 129 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SDF2Q99470 211 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDND1Q9NY35 253 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.54■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TSC22D2O75157 780 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 UBL3O95164 117 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PEPDP12955 493 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 IFI30P13284 250 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PRG2P13727 222 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RAG2P55895 527 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP5Q16690 384 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TIGD4Q8IY51 512 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HGDQ93099 445 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRL4Q9HBW9 690 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRSQ13332 1948 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RAF1P04049 648 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A5P22732 501 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 CMPK1P30085 196 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF680Q8NEM1 530 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 OR11H4Q8NGC9 324 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf36Q96KX1 117 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.53■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDH8O95206 1070 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB3BP20337 219 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 NRG3P56975 720 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 IRF4Q15306 451 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 OR1Q1Q15612 314 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 MTSS1LQ765P7 747 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 IL9P15248 144 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PITPNAQ00169 270 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 AGBL4Q5VU57 503 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SIAH3Q8IW03 269 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.52■□□□□ 0.88
HTATSF1-201ENST00000218364 RPE65Q16518 533 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK14Q16539 360 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 CMIPQ8IY22 773 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ABRACLQ9P1F3 81 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO10Q9HD67 2058 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 J3QLW9 94 aa20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF19P17023 458 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms