RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 PLA1AQ53H76 456 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 AMZ2Q86W34 360 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR4K13Q8NH42 304 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ABHD4Q8TB40 342 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LGR4Q9BXB1 951 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GNG8Q9UK08 70 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CBLCQ9ULV8 474 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SCN5AQ14524 2016 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR6C74A6NCV1 312 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FBXO45P0C2W1 286 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NPR2P20594 1047 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TEAD1P28347 426 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RAD52P43351 418 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CCR8P51685 355 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R38P59533 333 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 STX4Q12846 297 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A5Q14940 896 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CDS1Q92903 461 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NUS1Q96E22 293 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR7D2Q96RA2 312 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MS4A8Q9BY19 250 aa15.6■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CDHR4A6H8M9 788 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SURF4O15260 269 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PPP1R3DO95685 299 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 C6P13671 934 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ATF1P18846 271 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GDNFP39905 211 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KHKP50053 298 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TSPAN31Q12999 210 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NNATQ16517 81 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 BEX5Q5H9J7 111 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 HBMQ6B0K9 141 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR8S1Q8NH09 359 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FBXW5Q969U6 566 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 NDC1Q9BTX1 674 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ARL6Q9H0F7 186 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 QSOX1O00391 747 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 EPCAMP16422 314 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ADH7P40394 386 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 PUDPQ08623 228 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 VASNQ6EMK4 673 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FANK1Q8TC84 345 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 IMPA2O14732 288 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LIPCP11150 499 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ITGB8P26012 769 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 BTN3A2P78410 334 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 FUT5Q11128 374 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CRMP1Q14194 572 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KCNAB1Q14722 419 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 OPCMLQ14982 345 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM255AQ5JRV8 349 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 APOOLQ6UXV4 268 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SSX6Q7RTT6 188 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ADIPOR2Q86V24 386 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 VOPP1Q96AW1 172 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 LRIG1Q96JA1 1093 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 GHITMQ9H3K2 345 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.59■□□□□ 0.09
CTDP1-201ENST00000075430 A0A087WV48 116 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 ACSM4P0C7M7 580 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 SLC44A3Q8N4M1 653 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa15.58■□□□□ 0.08
CTDP1-201ENST00000075430 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms